Ein Transkriptionsfaktor ist in der Molekularbiologie ein Protein, das für die Initiation der RNA-Polymerase bei der Transkription von Bedeutung ist. Außerdem kann es bei der Regulation der Elongation und Termination beteiligt sein. Bei der transkription treten etwa geld. Transkriptionsfaktoren können an die DNA binden und den Promotor aktivieren oder reprimieren. Es gibt auch Transkriptionsfaktoren, die nicht direkt an die DNA, sondern zum Beispiel an andere DNA-bindende Proteine binden. Es werden allgemeine (basale) und genspezifische Transkriptionsfaktoren unterschieden. Allgemeine Transkriptionsfaktoren [ Bearbeiten | Quelltext bearbeiten] Allgemeine Transkriptionsfaktoren als Untereinheiten der zur Transkription benötigten Proteinkomplexe übernehmen verschiedene Aufgaben und binden dabei entweder direkt an die DNA, zum Beispiel an allgemeine Motive wie Promoterelemente (etwa die TATA-Box), an die RNA-Polymerase oder an andere Proteine des Präinitiationskomplexes. Diese "basalen" Transkriptionsfaktoren treten stets als Komplexe mit anderen Proteinen auf.
Die Aktivierung ist das Ende einer langen Signalübermittlungskette, die durch einen Rezeptor ausgelöst wird. Aktivatoren funktionieren nach zwei Prinzipien: Sie binden den RNA-Polymerasekomplex. Dies verleiht der Polymerase eine höhere Bindungs-Affinität zu dem aktivierten Promoter, dieser wird also nun verstärkt gebunden, beziehungsweise die Promoterstärke wird erhöht (maximal eine Initiation pro Sekunde), und die nachfolgende proteincodierende Sequenz wird verstärkt exprimiert. Posttranskriptionale Modifikation – Wikipedia. Sie haben Histon-Acetyl-Transferase Funktion oder rekrutieren solche. Durch die Acetylierung von Histonen wird das Chromatin aufgelockert, wodurch die RNA-Polymerase besser Zugang zur DNA bekommt. Sie kann daher besser an diese binden und damit kann auch effizienter transkribiert werden. Repressoren funktionieren nach einem umgekehrten Prinzip, Histon-Deacetylasen führen zu einer dichteren Verpackung der DNA, und durch die Blockade von Polymerasebindestellen folgt das Absenken der Bindungs-Affinität. Eine Komplexe Regulation kommt durch das netzwerkartige Zusammenspiel der vielen verschiedenen Transkriptionsfaktoren zustande.
Die H-Brücken zwischen den Basen in einer kurzen Region zwischen -12 und +4 um den Startpunkt der Transkription [2] öffnen sich, es entstehen zwei kurze Einzelstränge. "Verursacher" des Aufschmelzens der DNA sind die σ-Untereinheiten der RNA-Polymerase. Eine dieser σ-Untereinheiten, σ2 (in der Abbildung gelb), hat nämlich zwei "Taschen" (vergleichbar mit den aktiven Zentren von Enzymen), in die je eine Base der TATA-Box (in der Abbildung gelb) hineinpasst, nämlich Adenin an Position -11 und Thymin an Position -7 [2]. Man kann sich nun bildlich vorstellen, wie die σ-Einheit an diesen Basen "zieht" und somit die Doppelhelix öffnet. Transkriptionsfaktor. Unterstützt wird dies ja durch die vielen A- und T-Basen in der Promotor-Region, die nur durch je zwei H-Brücken zusammengehalten werden. Eine G- und C-reiche Region wäre viel schwerer aufzulösen. 4. Erste RNA-Synthese Nun beginnt die Synthese einer kurzen RNA, die vielleicht 10 bis 12 Nucleotide lang ist. Die RNA-Polymerase stellt sozusagen ihren eigenen Primer her.
Quellen: Alfred Nordheim, Rolf Knippers: Molekulare Genetik, 11. Auflage, Thieme-Verlag Stuttgart 2018. Jochen Graw: Genetik, 7. Auflage, Springer Spektrum, Berlin 2021.
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